深圳企业可以选择以下几种方式办理：
深圳市市场监督管理局官网
可以通过访问深圳市市场监督管理局的官方网站（网址： http://amr.sz.gov.cn/），点击“开办企业一窗通”进行在线办理。
广东政务服务网
另一个选择是访问广东政务服务网（网址： www.gdzwfw.gov.cn），选择“法人服务”，然后选择“办理企业注册”，再选择企业类型进行在线注册。
行政服务大厅
可以亲自到深圳市的行政服务大厅办理，例如福田区行政服务大厅位于深圳市福田区莲花街道福中三路1号B区一层行政服务大厅东厅9-21号窗口。
营业执照审批中心
可以到深圳市市场监督管理局的营业执照审批中心办理，地址为深圳市福田区深南中路2008号，营业时间为每周一周五上午9:00-12:00，下午14:00-17:00。
在线办理系统
企业还可以通过深圳市市场监督管理局的“网上营业执照审批系统”进行在线办理，填写企业营业执照申请表，上传所需资料，提交申请，并支付费用，审核通过后可以网上查询或到审批中心领取营业执照。
建议选择最便捷的途径，如通过深圳市市场监督管理局的官方网站或广东政务服务网进行在线办理，以节省时间和精力。
